Wie kann ich Prüfen, ob mein Index in Ordnung ist?

mit dem tool bennoadmin:
java -jar bennoadmin.jar query /path/to/mailarchive/index/ "suchbegriff"
oder
java -jar bennoadmin.jar check-consistency /path/to/mailarchive/repository /path/to/mailarchive/index

Wo kann ich in bennosearch die Pfade für den Index und das Repository einstellen?

Siehe Quick-Install Guide (PDF).